Микробиом кишечника (аэробы, анаэробы, Candida spp., мицелиальные грибы). Идентификация методом MALDI-TOF. Антибиотикограмма. Антимикотикограмма

Микробиом кишечника — это сложная экосистема микроорганизмов, участвующая в пищеварении, поддержании местной иммунной защиты и общем балансе организма. В норме различные группы бактерий и грибов сосуществуют в определенном равновесии. Но после антибиотикотерапии, изменений в питании, стресса, хронических заболеваний или других факторов этот баланс может нарушаться. В таких случаях отдельные условно-патогенные микроорганизмы могут чрезмерно размножаться, а количество представителей нормальной микрофлоры — снижаться. Это может сопровождаться вздутием живота, нестабильным стулом, склонностью к запорам или диарее, дискомфортом в кишечнике, а также другими неспецифическими проявлениями, требующими уточнения причины. Исследование «Микробиом кишечника» позволяет оценить состав культивируемой кишечной микрофлоры и выявить клинически значимые аэробные, анаэробные бактерии, дрожжевые грибы Candida spp. и мицелиальные грибы. Идентификация микроорганизмов проводится методом MALDI-TOF-масс-спектрометрии, что позволяет определить выделенные микроорганизмы до вида. Это важно, поскольку различные представители одной группы могут иметь разное клиническое значение и разную чувствительность к препаратам. При наличии клинически значимого роста бактерий проводится антибиотикограмма — определение чувствительности выделенных микроорганизмов к антибактериальным препаратам.  При обнаружении грибковой флоры проводится антимикотикограмма — определение чувствительности к противогрибковым препаратам. Таким образом, исследование помогает не только выявить, какие микроорганизмы преобладают в кишечной микрофлоре, но и предоставить дополнительную информацию для выбора дальнейшей тактики лечения.

Показания:

Исследование рекомендуется:

• при длительных нарушениях пищеварения (метеоризм, хроническая диарея/запор, боль в кишечнике);
• после длительного курса антибиотиков;
• при подозрении на кандидоз или другие грибковые инвазии кишечника;
• при аллергических заболеваниях, связанных с нарушением микробиома.

Отбор материала осуществляется самим пациентом.
Перед отбором материала следует опорожнить мочевой пузырь.
Материал для исследования необходимо собирать утром в стерильную емкость для кала с
ложечкой.
Кал собрать на чистую поверхность, например, на плотную стерильную бумагу, не впитывающую
воду (в домашних условиях прогладить горячим утюгом и свернуть проглаженной
поверхностью внутрь) или в горшок (предварительно хорошо обработать губкой с мылом и несколько
раз промыть водопроводной водой, затем обдать кипятком и охладить).
Заполнить контейнер средней порцией кала не более чем на 1/3.
Контейнер следует плотно закрыть крышкой и упаковать в чистый одноразовый пакет.

• Материал, отобранный в стерильную емкость для кала с ложечкой, необходимо доставить в лабораторию.
• Важно: Для обеспечения точности анализа биоматериал не подлежит замораживанию и должен быть доставлен в течение 2 часов, поэтому образец принимается исключительно в главном отделении медицинского сервиса (ст. м. Житомирская, пр-т Берестейский, 119-121, корп. 5).

• Анализ кала на дисбактериоз целесообразно проводить до начала лечения антимикробными препаратами или через 7 дней после окончания терапии;
• В аптеке необходимо заранее приобрести емкость для кала с ложечкой;
• Собирать кал для исследования нужно утром. Дефекация должна быть естественной (не применять клизму, слабительные средства);
• Перед отбором материала следует опорожнить мочевой пузырь;
• Анализ кала на дисбактериоз следует проводить перед выполнением ректороманоскопии и других диагностических манипуляций в области кишечника и желудка;
• Анализ кала на дисбактериоз женщинам необходимо сдавать до менструации или через 2 суток после окончания менструации.